Название города переписывал каждый правитель по очереди. Самое древнее его название, Мазака, продержалось до Рима; римляне переименовали его в Кесарию, город императора; арабы говорили Кайсария; после тюркского завоевания Анатолии оно стало Kayseriye, а с Республикой — Kayseri.

Что находится рядом, объясняет остальное. Kültepe, сразу за современным городом, был населён с IV тысячелетия до н. э. — халколита — через ассирийский, хеттский и фригийский периоды и до конца римского времени, и он сохранился как музей под открытым небом всех этих эпох. Kayseri вырос возле этого центра и несёт глубокие следы каждой из этих цивилизаций.

Тюркское правление началось в 1067 году, когда сельджукский полководец Афшин взял город. После Сельджукского государства пришли бейлик Эретнидов, Дулькадириды, Кады Бурханеддин, Карамониды и османы. На протяжении всех этих времён, а прежде всего при сельджуках, Kayseri был важным центром тюркской культуры, и медресе, гробницы и мечети тех веков до сих пор стоят в старом городе.