Urla’daki kazılar, Orta Kalkolitik’ten geç Roma dönemine uzanan yedi mimari katman belirlemiştir. Bunlar birlikte yalnızca bu yerleşim için değil, bütün Ege dünyası için önemli bir kronolojik dizi oluşturur. En eski katman şu anda MÖ beşinci binyılın başına tarihlenmektedir.
Buluntuların gösterdiği, baştan beri bir liman kentidir. En eski kültürel katmanlarından itibaren yerleşim denizaşırı ticaretin merkezinde durdu ve Erken Tunç Çağı’nda planlı kent fikri yerleşirken farklı bir nitelik kazandı. Klasik dönemde adı Klazomenai idi.
MÖ 1200 dolaylarında başlayan Deniz Kavimleri göçü, şehir devletlerini kendi başlarına birer uygarlık merkezi hâline getirdi. MÖ 8. yüzyıla gelindiğinde Klazomenai siyasi oluşumunu tamamlamış, uygarlık tarihindeki yerini almış ve şehir devletleri sistemine katılmıştı.
MÖ 6. yüzyıldan itibaren bir dizi istila ve ayaklanmaya uğradı ve bunlar yüzünden halk anakaradaki kenti terk ederek karşıdaki adaya — bugün Karantina Adası olarak bilinen — yerleşti. Adadaki kentin MS 5. yüzyılda terk edildiği anlaşılıyor. Klazomenai, orada kazılan zeytinyağı atölyesi ve yarımadanın bağları aşağıda her biri kendi sayfasına sahiptir.
