Kütahya’nın tarihi yedi bin yıl geriye uzanır ve topraklarındaki katmanlar kesintisizdir: Neolitik, Kalkolitik, Erken Tunç, Hitit, Frig, Helenistik, Roma, Bizans, Selçuklu, Germiyan ve Osmanlı. Eski kaynaklar kenti masalcı Ezop’un doğum yeri olarak verir ve dönemin sikkeleri kentin o zamanlar Kotiaeion olarak adlandırıldığını gösterir.
Bu topraklara yerleşen en eski halk, MÖ 12. yüzyılın sonunda Anadolu’ya göç eden ve Hitit devleti çöktükten sonra bölgeyi alan Frigler’di. MÖ 676’da Kimmerler Frig kralı III. Midas’ı bozguna uğrattı ve Kütahya ile çevresinin hâkimi oldu. Lidyalılar kral Alyattes önderliğinde Kimmer egemenliğini kırarak yönetimi devraldı.
