El nombre de la ciudad es la unión de dos nombres. La escarpada colina cónica del centro, de 226 metros de altura entre montañas volcánicas, atrae a la gente desde los hititas y, aunque ya era defendible, se rodeó de tres líneas de muralla: inferior, media y superior. Cada gobernante le dio su nombre: Hapanuwa para los hititas, Akroinon para romanos y bizantinos, Karahisar-ı Devle y Karahisar-ı Sahip para los selyúcidas, los principados y los otomanos.
La otra mitad procede de una planta. La adormidera se cultiva aquí desde el siglo II.º a. C. como medio de vida, y el latín opium, pronunciado localmente afion, dio a la ciudad su otro nombre. Con el tiempo ambos se unieron en Afyonkarahisar, una forma documentada por primera vez en los registros judiciales del siglo XVII.º.
