L'histoire de Kütahya remonte à sept mille ans, et les couches de son sol sont ininterrompues : néolithique, chalcolithique, bronze ancien, hittite, phrygienne, hellénistique, romaine, byzantine, seldjoukide, germiyanide et ottomane. Les sources antiques en font le lieu de naissance du fabuliste Ésope, et les monnaies de l'époque montrent que la ville s'appelait alors Kotiaeion.

Les plus anciens à s'établir sur ce sol furent les Phrygiens, qui migrèrent en Anatolie à la fin du XIIe siècle av. J.-C. et prirent la région après l'effondrement de l'État hittite. En 676 av. J.-C., les Cimmériens mirent en déroute le roi phrygien Midas III et devinrent maîtres de Kütahya et de son district. Les Lydiens brisèrent la domination cimmérienne sous le roi Alyatte et lui succédèrent.