Beaucoup de villes anatoliennes antiques avaient un dieu ou un héros fondateur — un ktistes — et Amasya en est une. Une monnaie de la ville frappée sous l’empereur Septime Sévère, qui régna de 193 à 211 apr. J.-C., porte la légende ERMHC KTICAC THN POLIN, et c’est sur cette base que l’on tient Hermès pour le dieu fondateur d’Amasya.

Le nom lui-même a changé avec chaque souverain. Les documents hittites suggèrent que le premier nom connu était Hakmiš, et il a probablement duré jusqu’à la conquête perse. Sous le royaume du Pont, la ville s’appelait Amasseia : le mot apparaît clairement sur les monnaies de la ville frappées à partir du IIe siècle av. J.-C., et le géographe Strabon, qui est né ici, emploie lui aussi Amaseia.